[R-br] COMPARAR TRATAMENTOS

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[R-br] COMPARAR TRATAMENTOS

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Boa noite, os dados abaixo referem-se a  10 tratamentos e ao estagio de uma doença. O grau 2 é o estágio maior.

            doenca
Trat     0 1 2 Total              
GM1   3 2 1     6
GM2   0 2 4     6
GM3   1 3 2     6
GM4   0 3 2     5
GM5   0 4 2     6
GM6   0 1 5     6
GM7   1 1 4     6
GM8   0 0 6     6
GM9   0 4 1     5
GM10  0 0 6     6


Fiz um teste de associação (Exato de Fisher) e verifiquei que ha uma associação entre o tratamento e o estagio da doença. Agora gostaria de verificar qual dos tratamentos é o mais eficiente.

Posso testar também:

G1xG2
G3xG4
G5xG6
G7xG8
G9XG10

Alguém tem alguma sugestão?


[  ]'s.
Prof. Edson Lira, Me
Estatístico
Manaus-Amazonas

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Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
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[R-br] RES: COMPARAR TRATAMENTOS

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Enviado do Email para Windows 10

 

De: [hidden email]
Enviado:quarta-feira, 28 de novembro de 2018 23:46
Para: [hidden email]
Cc:[hidden email]
Assunto: [R-br] COMPARAR TRATAMENTOS

 

Boa noite, os dados abaixo referem-se a  10 tratamentos e ao estagio de uma doença. O grau 2 é o estágio maior.

 

            doenca

Trat     0 1 2 Total              

GM1   3 2 1     6

GM2   0 2 4     6

GM3   1 3 2     6

GM4   0 3 2     5

GM5   0 4 2     6

GM6   0 1 5     6

GM7   1 1 4     6

GM8   0 0 6     6

GM9   0 4 1     5

GM10  0 0 6     6

 

 

Fiz um teste de associação (Exato de Fisher) e verifiquei que ha uma associação entre o tratamento e o estagio da doença. Agora gostaria de verificar qual dos tratamentos é o mais eficiente.

 

Posso testar também:

 

G1xG2

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G5xG6

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Alguém tem alguma sugestão?

 

 

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Caro Edson

Eu montaria a matriz desta forma, a seguir, faria uma análise não paramétrica e faria a escala de notas começando do 1, eliminando o dígito 0.

Trat        rep         nota

GM0      d1           0

GM1      d1           3

GM2      d1           0

GM3      d1           1

GM4      d1           0

GM5      d1           0

GM6      d1           0

GM7      d1           1

GM8      d1           0

GM9      d1           0

GM10   d1           0

GM0      d2           1

GM1      d2           2

GM2      d2           2

GM3      d2           3

GM4      d2           3

GM5      d2           4

GM6      d2           1

GM7      d2           1

GM8      d2           0

GM9      d2           4

GM10   d2           0

GM0      d3           2

GM1      d3           1

GM2      d3           4

GM3      d3           2

GM4      d3           2

GM5      d3           2

GM6      d3           5

GM7      d3           4

GM8      d3           6

GM9      d3           1

GM10   d3           6

Espero ter ajudado.

Brito.

 


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Re: [R-br] RES: COMPARAR TRATAMENTOS

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Obrigado Antonio

Prof. Edson Lira, Me
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Em quinta-feira, 29 de novembro de 2018 08:56:06 AMT, Antonio Silva <[hidden email]> escreveu:


 

 

Enviado do Email para Windows 10

 

De: [hidden email]
Enviado:quarta-feira, 28 de novembro de 2018 23:46
Para: [hidden email]
Cc:[hidden email]
Assunto: [R-br] COMPARAR TRATAMENTOS

 

Boa noite, os dados abaixo referem-se a  10 tratamentos e ao estagio de uma doença. O grau 2 é o estágio maior.

 

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Trat     0 1 2 Total              

GM1   3 2 1     6

GM2   0 2 4     6

GM3   1 3 2     6

GM4   0 3 2     5

GM5   0 4 2     6

GM6   0 1 5     6

GM7   1 1 4     6

GM8   0 0 6     6

GM9   0 4 1     5

GM10  0 0 6     6

 

 

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Caro Edson

Eu montaria a matriz desta forma, a seguir, faria uma análise não paramétrica e faria a escala de notas começando do 1, eliminando o dígito 0.

Trat        rep         nota

GM0      d1           0

GM1      d1           3

GM2      d1           0

GM3      d1           1

GM4      d1           0

GM5      d1           0

GM6      d1           0

GM7      d1           1

GM8      d1           0

GM9      d1           0

GM10   d1           0

GM0      d2           1

GM1      d2           2

GM2      d2           2

GM3      d2           3

GM4      d2           3

GM5      d2           4

GM6      d2           1

GM7      d2           1

GM8      d2           0

GM9      d2           4

GM10   d2           0

GM0      d3           2

GM1      d3           1

GM2      d3           4

GM3      d3           2

GM4      d3           2

GM5      d3           2

GM6      d3           5

GM7      d3           4

GM8      d3           6

GM9      d3           1

GM10   d3           6

Espero ter ajudado.

Brito.

 


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Re: [R-br] COMPARAR TRATAMENTOS

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In reply to this post by R-br mailing list
Edson,

Com seis casos por tipo de tratamento, não vejo como você conseguirá somente com um teste estatístico separar dos tratamentos o "mais eficiente".

Com dez tratamentos você teria que fazer 45 testes o que exigiria que o limiar de rejeição da hipótese nula (que todos os tratamentos são equivalentes no seu caso) fosse diminuído, usando-se alguma correção, como a de Bonferroni ou Holm, para eludir o problema da inflação do Erro Tipo I ou a FWER -- Family Wise Error Rate.

O teste exato de Fisher não tem um teste post hoc idealizado para permitir fazer comparações entre grupos após o teste omnibus ter detectado alguma diferença entre os tratamentos, permitindo uma análise a partir desse resultado.

Note-se que olhando os dados que você postou, e se eu entendi corretamente a descrição, a linha do tratamento GM1 seria a "mais promissora" pois tem mais casos no estágio 0.

Ora: um teste qui-quadrado dessa tabela contra a hipótese nula de que eles viriam de uma amostragem aleatória onde em regime (em "média") o número de casos por estágio seria igual nos dá um valor-p de 0,6, ou seja a hipótese nula dificilmente seria rejeitada neste caso...

Na contrapartida, na linha do tratamento G10 (que, de novo, se entendi bem seria o pior dos tratamentos com todos os casos chegando ao estágio 2), obtém-se para o mesmo teste o valor-p de 0,0025, que para muitos pesquisadores seria um resultado significante estatisticamente.

Será que seu teste de Fisher só está mostrando essa diferença toda?

HTH
--
Cesar Rabak


On Thu, Nov 29, 2018 at 12:46 AM Edson Lira por (R-br) <[hidden email]> wrote:
Boa noite, os dados abaixo referem-se a  10 tratamentos e ao estagio de uma doença. O grau 2 é o estágio maior.

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GM2   0 2 4     6
GM3   1 3 2     6
GM4   0 3 2     5
GM5   0 4 2     6
GM6   0 1 5     6
GM7   1 1 4     6
GM8   0 0 6     6
GM9   0 4 1     5
GM10  0 0 6     6


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